Enhancing stereo matching performance by colour normalisation and specularity removal

A method to enhance the performance of stereo matching is presented. The position of the specular light reflection on an object surface varies due to the change in the position of the camera, light source, object or all combined. Additionally, there may be situations exhibiting a colour shift owing to a change in the light source chromaticity or camera white balance settings. These variations cause misleading results when stereo matching algorithms are applied. In this reported work, a single-image-based statistical method is used to normalise source images. This process effectively eliminates non-saturated specularities regardless of their positions on the object. The effect of specularity removal is tested on stereo image pairs. © 2011 The Institution of Engineering and Technology

Training Data Generation for U-Net Based MRI Image Segmentation using Level-Set Methods

Image segmentation has been a well-addressed problem in pattern recognition for the last few decades. As a sub-problem of image segmentation, the background separation in biomedical images generated by magnetic resonance imaging (MRI) has also been of interest in the applied mathematics literature. Level set evolution of active contours idea can successfully be applied to MRI images to extract the region of interest (ROI) as a crucial preprocessing step for medical image analysis. In this study, we use the classical level set solution to create binary masks of various brain MRI images in which black color implies background and white color implies the ROI. We further used the MRI image and mask image pairs to train a deep neural network (DNN) architecture called U-Net, which has been proven to be a successful model for biomedical image segmentation. Our experiments have shown that a properly trained U-Net can achieve a matching performance of the level set method. Hence we were able to train a U-Net by using automatically generated input and label data successfully. The trained network can detect ROI in MRI images faster than the level-set method and can be used as a preprocessing tool for more enhanced medical image analysis studies

Yüzey geometrisi ve yansıma özelliklerinin görüntü tabanlı yöntemler kullanılarak birleşik geriçatımı

Thesis (Doctoral)--Izmir Institute of Technology, Electronics and Communication Engineering, Izmir, 2015Includes bibliographical references (leaves: 93-101)Text in English; Abstract: Turkish and Englishxvii, 118 leavesIn this thesis, we aim to capture realistic geometrical descriptions of real world scenes and objects with a special effort to characterize reflection properties. After a brief review of the stereo imaging literature, we show our contributions to enhance stereo matching performance by identifying and eliminating specular surface reflections. The identification of specular reflection can be done both passively and actively. We use dichromatic-based methods to identify and eliminate specular reflections passively. We utilize polarization imaging methods to do the same job actively. In this work we also study structured light based methods that can give better reconstruction results compared to stereo imaging methods. We propose three laser scanners equipped with a pair of line lasers and a method to calibrate these systems. Another convenient way to obtain good surface reconstruction results using structured light is to use projectors that can be used as a light source that project complicated patterns. We show our results from a digital camera-projector-based scanning system as well. This system can robustly generate a very dense reconstruction of surfaces. We also use the projector based scanning system to determine the surface reflection properties. Using high dynamic range imaging (HDRI) techniques makes it possible for us to estimate scene radiance values. Since we can determine the incoming and outgoing light directions, we are able to measure bidirectional reflectance distribution function (BRDF) values from reconstructed surface points for corresponding directions. If the sample surface have not only diffuse reflection components but also a sufficient amount of specular highlights, it is possible to approximate BRDF corresponding to a surface by fitting an analytical BRDF model to the measured data. In our work we preferred to use Phong BRDF model. Finally, we present results with rendered synthetic images where the parameter values of the Phong model were estimated using scans of real objects.Bu tez çalışmasında gerçek sahnelerin ve nesnelerin gerçekçi geometrik tanımlarını, aynı zamanda yansıma özelliklerini de karakterize etmeye çalışarak elde etmeye çalışıyoruz. Stereo imgeleme literatürü ile ilgili genel bir özet yaptıktan sonra stereo imgeleme yöntemlerindeki stereo eşleşme başarımının aynasal yansımaların tanımlanması ve yok edilmesi ile arttırılabilmesine yönelik kendi katkılarımızı da sunuyoruz. Aynasal yansıma özelliklerinin tanımlanması pasif ve aktif olarak gerçekleştirilebilmektedir. Dikromatik tabanlı yöntemler bu işlemin pasif olarak gerçekleştirilebilmesini sağlamaktadır. Polarizasyon imgeleme yöntemlerini kullanarak aynı işi aktif olarak da gerçekleştiriyoruz. Bu çalışmada aynı zamanda stereo imgeleme yöntemlerine nazaran çok daha iyi geri çatım sonuçları verebilen yapısal aydınlatma tabanlı yöntemleri de ele aldık. Öncelikle çift çizgisel lazer kullanan üç ayrı tarayıcı sistem ve bunlara ilişkin bir kalibrasyon yöntemi öneriyoruz. Yapısal aydınlatma kullanarak iyi bir yüzey geri çatımı elde etmek için kullanılabilecek olan bir diğer yöntem ise karmaşık örüntüler yansıtabilen projektörleri kullanmaktır. Burada aynı zamanda dijital fotoğraf makinesi ve projektör ile oluşturulan bir tarama sitemi ile elde ettiğimiz sonuçları da gösteriyoruz. Bu sistem yüzeylere ait çok yoğun geri çatımların elde edilebilmesini sağlamaktadır. Projektör tabanlı sistemi aynı zamanda yüzeylerin yansıtıcılık özelliklerinin geri çatımı için de kullanıyoruz. Yüksek dinamik erimli imgeleme (YDEI) teknikleri sahnedeki ışınırlık değerlerini tahmin edebilmemizi mümkün kılmaktadır. Yüzeye gelen ve yüzeyden yansıyan ışık yönlerini de belirleyebildiğimiz için geri çatılan yüzey noktalarındaki çift yönlü yansıma dağılımı fonksiyonu (ÇYDF) değerlerini ilgi yönler için ölçebiliyoruz. Şayet örnek yüzey yayınık yansıma bile¸seninin yanısıra yeterli müktarda aynasal yansıma bileşenine de sahip ise ölçülen veriye analitik bir ÇYDF fonsiyonunun oturtulması ile yüzeyin ÇYDF’sine yaklaşmak mümkün olabilmektedir. Çalışmamızda Phong ÇYDF modelini kullanmayı tercih ettik. Son olarak elde ettiğimiz sonuçları gerçek nesnelerin taranması ile kestirilen Phong ÇYDF modeli parametre değerlerinin kullanılması ile gerçeklenmiş sentetik imgelerle sunuyoruz

A case study on logging visual activities: Chess game

Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Electronics and Communication Engineering, Izmir, 2005Includes bibliographical references (leaves: 46-47)Text in English; Abstract: Turkish and Englishix, 47 leavesAutomatically recognizing and analyzing visual activities in complex nenvironments is a challenging and open-ended problem. In this thesis this problem domain is visited in a chess game scenario where the rules, actions and the environment are well defined. The purpose here is to detect and observe a FIDE (Federation International des Echecs) compatible chess board and to generate a log file of the moves made by human players. A series of basic image processing operations have been applied to perform the desired task. The first step of automatically detecting a chess board is followed by locating the positions of the pieces. After the initial setup is established every move made by a player is automatically detected and verified. A PC-CAM connected to a PC is used to acquire images and implement the corresponding software. For convenience, .Intel R Open Source Computer Vision Library (OpenCV). is used in the current software implementation

İstanbul Borsasında ikincil arzlarda ilan etkisi

Bu araştırmanın sonucunda Türkiye' deki ikincil arzların ilan gününde pozitif abnormal getiri gözlemlenmiştir. Genelde ikincil halka arzlar tahsisli satış yoluyla yapılmakla birlikte, çok az miktarı tahsissiz yapılmaktadır. Bununla birlikte ortakların hisse senedi satışı ve özelleştirme satışları ikincil halka arzlar kapsamındadır. Hertzel ve Smith (1992)' in Bilgi Hipotezi, Miller and Rock (1985)'un Nakit Akışı Sinyali Hipotezi, Jensen (1986)' nin Boşa Harcanan Yatırımlar Hipotezi, Eckbo ve Masulis (1992)' in Arz Methodları Hipotezi ve Modigliani ve Miller(1958)'in Kaldıraç Değişikliği Hipotezi tahsisli halka arzlarda gözlenen positif abnormal getiriyi açıklamaktadır. Şirketler hisse senetleri primli olduğu zaman tahsissiz olarak halka arz yapmakta, fakat iskontolu oldukları zaman tahsisli olarak halka arz yapmaktadırlar. Tahsisli halka arzların ilanı şirket değerinin yükselmesine sebeb olur. Fakat ihraç edilen nominal hisse senedi miktarı, tahsisli halka arzlarda şirket değerini negatif olarak etkilemektedir. Ayrıca piyasalar yükselirken yapılan tahsisli halka arzların ilanı piyasada pozitif etki yapmaktadır. Bu da tahsisli halka arzlarda fırsat penceresinin bulunduğunu göstermektedir. Vekillerin negatif getirili projelere yapabileceği yatırımlardan kaynaklanan vekil maliyeti tahsisli satışların ilan gününde bir etkiye sahiptir. Ayrıca arz maliyetinin ilan günü getirisi üzerinde negatif etkisi vardır. Son olarak hisse senedi satışından dolayı azalan borç kaldıracının ilan gününde negatif bir etkisi de bulunmaktadır. This research shows that positive abnormal return is observed at the announcement day of seasoned equity offerings in Turkey. Although most of the seasoned equity offerings are private placements in Turkey, few of them are public offerings. Privatization offerings and secondary offerings are also in the context of seasoned equity offering in Turkey. Hertzel and Smith (1992)'s Information Hypothesis, Miller and Rock (1972)'s Cash Flow Signalling Hypothesis and Wasted Investment Hypothesis of Jensen (1986), Eckbo and Masulis (1992)'s Flotation method hypothesis and Modigliani and Miller (1958)'s Leverage Change Hypothesis explain the positive abnormal return in private placements. The firms make public offerings when they are overvalued but they make private placements when they are undervalued. The announcement of private placement makes firm value increase. However issue size affect firm it negatively when the private placements are announced. Furthermore, when market is rising, the announcement of seasoned equity offering signals good news to the market. This shows that windows of opportunity exist in private placement. The agency cost result from the fact that the manager may waste the investment in negative NPV project has some affect on the announcement day abnormal return. In addition the market capitalizes expected flotation cost on announcement day return. Finally, the decrease in leverage due to seasoned equity offering results in decrease in abnormal return at the announcement day also

Calibration of a 3D environmet scanner with a pair of line lasers

20th Signal Processing and Communications Applications Conference, SIU 2012; Fethiye, Mugla; Turkey; 18 April 2012 through 20 April 20123B lazer tarayıcılar yüzey geometrisinin yakalanması için yaygın olarak kullanılan sistemlerdir. Geleneksel lazer tarayıcı sistemler bir adet lazer ışık kaynağına sahiptir. Bu çalışmada iki adet lazer ışık kaynağına sahip bir 3B lazer tarayıcı ele alınmıştır. Bu tarayıcı özellikle sahnelerdeki örtme etkisinin en küçüklenebilmesini sağlamaktadır. Ancak birden fazla lazer kaynağına sahip lazer tarayıcılar için kalibrasyon önemli bir problem olmaktadır. Çalışmamızda bu sistemlerde karşılaşılan kalibrasyon problemi tanımlanmıştır. Bu problemin çözümü için taranan sahnelerdeki dikgenlik, eş-düzlemsellik bilgileri kullanılmıştır.3D laser scanners are widely used systems to capture surface geometry. Conventional laser scanners have one laser source. In this study, a laser scanner systems with two laser sources is considered. The scanner is capable of minimizing the effect of occlusion in the scene. But the calibration issue becomes more complicated for scanners having more than one laser source. In our study the calibration problem of such scanners are defined. Some scene specific informations like orthogonalities, co-planarities are used for solving this problem. © 2012 IEEE

Calibration of double stripe 3D laser scanner systems using planarity and orthogonality constraints

In this study, 3D scanning systems that utilize a pair of laser stripes are studied. Three types of scanning systems are implemented to scan environments, rough surfaces of near planar objects and small 3D objects. These scanners make use of double laser stripes to minimize the undesired effect of occlusions. Calibration of these scanning systems is crucially important for the alignment of 3D points which are reconstructed from different stripes. In this paper, the main focus is on the calibration problem, following a treatment on the pre-processing of stripe projections using dynamic programming and localization of 2D image points with sub-pixel accuracy. The 3D points corresponding to laser stripes are used in an optimization procedure that imposes geometrical constraints such as coplanarities and orthogonalities. It is shown that, calibration procedure proposed here, significantly improves the alignment of 3D points scanned using two laser stripes

De novo t(1;6)(p13p21.3) Dengeli Resiprokal Translokasyonun İnfertilite ile İlişkisi

İnfertilite tüm dünyada çiftlerin yaklaşık %15’ini etkileyen önemli bir sağlık sorunudur. İnfertilite hem erkek hem dekadın kaynaklı faktörler ile ortaya çıkabilir. Vakaların yaklaşık %40’ında tiyoloji belirsizdir. Dengeli resiprokaltranslokasyonlar, insanlarda en yaygın olarak karşılaşılan yapısal kromozom anomalileridir ve infertilite ile yakındanilişkilidir. Dengeli resiprokal translokasyonlar çoğunlukla taşıyıcıların fenotipini etkilemez ancak kromozomal olarakdengesiz gamet oluşturma yönünden bu kişiler anlamlı şekilde artmış riske sahiptir. 6p21.3 kromozomal bölgesiinfertilite ile ilişkili birçok geni barındırmaktadır. 6p21.3 bölgesini içine alan dengeli resiprokal translokasyonlargenellikle infertilite ile ilişkilendirilmiştir. Bu çalışmada bilim dalımıza infertilite nedeni ile refere edilen çiftten yapılankaryotip analizi sonucunda erkekte tespit ettiğimiz t(1;6)(p13p21.3) dengeli resiprokal translokasyonun infertiliteyleilişkisi üzerinde durulmuştur